PWS is een genetische aandoening en daarom niet te genezen.  De genetische fout zit in elke cel van het lichaam en is niet te repareren. 
Wel zijn er mogelijkheden om symptomen of klachten te behandelen; dit noemt men symptoombestrijding. Zo kunnen kinderen met PWS behandeld worden met groeihormoon ter bevordering van groei en verbetering van lichaamssamenstelling en glucocorticosteroïden in verband met onvoldoende stresshormoon tijdens ziekte.
Indien er sprake is van een tekort aan geslachtshormonen of schildklierhormonen kan hiervoor een behandeling gegeven worden.
Daarnaast is begeleiding door onder andere een fysiotherapeut, een diëtist voor verstandelijk gehandicapten en een logopedist van groot belang in de ontwikkeling. Goede afstemming tussen de professionals is essentieel. Patiënten  met PWS hebben veel baat bij een uniforme aanpak.