Op de kinderleeftijd houden de voedingsproblemen over het algemeen aan. Voeding-gerelateerd gedrag komt vaak meer op de voorgrond naarmate kinderen ouder worden en een eigen wil ontwikkelen. Kinderen met PWS houden van regelmaat en een duidelijke structuur in de dag, ook met betrekking tot eten. Ze vinden het soms lastig om te gaan met veranderingen en kunnen sommige situaties niet overzien. Hierdoor ontstaat onduidelijkheid en onzekerheid, wat stress en spanning kan veroorzaken.
Bepaalde gedragingen, zoals het telkens weer opnieuw uitvoeren van een handeling, driftbuien en/of overmatig krabben en pulken aan de huid (skin picking) kan steeds meer op de voorgond komen te staan tijdens de kinderleeftijd. Kinderen tussen 6 en 12 jaar hebben vaker vroegtijdige puberteitsbeharing, slaapgerelateerde ademhalingsproblemen, een kromming van de wervelkolom (scoliose) en platvoeten.